Para cumplir su misón y de acuerdo a lo previsto en el artículo 13 de la Ley de Aguas Nacionales, los Consejos de Cuenca tienen como objetivos generales, proponer y promover la ejecución de planes, programas y acciones para:

• Lograr el equilibrio entre oferta y demanda de agua en la Cuenca para sus diversos usos.
• El saneamiento de las cuencas, subcuencas, barrancas, acuíferos y cuerpos receptores de agua para prevenir, detener o corregir su contaminación.
• La conservación, preservación y mejoramiento de los ecosistemas de las cuencas con los que el agua forma sistemas naturales indivisibles.
• El uso eficiente y sustentable del agua en todas las fases del ciclo hidrológico.

Impulsar una cultura del agua que considere a este elemento como un recurso vital y escaso, difundiendo su valor económico, social y ambiental y alentando la participación de la sociedad en su cuidado y uso sustentable.